由国家农业部认定的国家海水鱼类加工技术研发分中心（厦门）于2011年3月4日在福建省水产研究所正式挂牌成立。中心现有科研人员16人，其中高级职称7人、博士5人，硕士6人。拥有包括喷雾干燥设备、高压超滤设备、板框过滤设备、电气两用式杀菌锅、高速低温离心机、全自动微生物分析仪、气质联用仪、液相色谱等先进的加工设备及分析仪器。分中心以水产品保鲜加工及综合利用、海洋活性物质开发、水产品质量与安全为主要研究方向。承担着带动区域海水鱼加工研发发展、促进海水鱼加工产业结构调整、实现水产加工增效、渔民增收等重任。分中心充分利用人才资源优势，以市场为导向，以科技为依托，本着“创新严谨、科研为民”的工作理念，在海水鱼类精深加工、海洋生物活性物质研究、水产品质量安全监测等领域开展创新特色的研究工作。①新产品开发与综合利用：以海水鱼类及其加工副产物为原料，综合运用低温干燥、微胶囊化、低温凝胶化、微粒化、酶法交联、挤压重组等食品加工新技术，开发风味重组鱼粒、高凝胶强度鱼糜、海鲜调味品、超细微粉末食品等高档水产加工制品；②海洋活性物质开发：以特定海水鱼为原料，重点开发海洋抗肿瘤、抗病毒、抗氧化、降血压、降血脂等活性物质，研制海洋活性多肽、糖蛋白、胶原蛋白、壳聚糖、甲壳低聚糖、氨基葡萄糖软骨素、多烯不饱和脂肪酸等健康保健产品；③水产品质量安全与风险评估：对水产品中渔药、重金属、有毒物质等化学污染物残留超标等问题进行监测，开展相关的水产品风险评估工作，制定产品标准、安全卫生标准及化学污染物检测标准等。④ 建设产业示范基地：与福建省海水鱼类加工企业合作，将技术优势、人才优势和生产优势、资金优势相结合，进行科研成果产业转化，建设相关水产品加工生产示范基地，促进产业发展。近年来，分中心承担并完成了多项国家级、省部级科研项目，其中已完成的项目“水产品加工副产物的高值化开发与应用技术研究”经评审认为达国际同类研究先进水平，并获得2012年国家海洋局海洋创新成果一等奖、福建省科学技术进步三等奖、厦门市科学技术进步二等奖等荣誉；在研项目包括国家海洋局海洋公益性行业科研专项“新型琼脂糖提取分离技术的产业化应用及相关产品的制备”；国家科技支撑项目“大宗低值加工新产品及超低温急冻装备开发与产业化示范”；国家级星火计划重大项目“鲍综合加工新技术集成与产业化示范”等，各项目进展顺利，已取得一定的科研成果；同时，在标准化研究中也倾注了大量的精力，制定了《罐装冷藏蟹肉》、《水产品中诺氟沙星、环丙沙星、恩诺沙星、氧氟沙星、噁喹酸、氟甲喹残留量的测定液相色谱法》、《冻烤鳗 良好生产规范》、《水产品中鲜度指标K值的测定》等国家、地方及行业标准。